硫酸铜可以用于杀灭真菌。与石灰水混合后生成波尔多液，作为杀菌剂，用于控制柠檬、葡萄等作物上的真菌，防止果实等腐烂。稀溶液用于水族馆中灭菌 以及除去蜗牛。由于铜离子对鱼有毒，用量必须严格控制。大多数真菌只需非常低浓度的硫酸铜就可被杀灭，大肠杆菌也可以被控制。 此外，养殖业也用作饲料添加剂微量元素铜的主要原料。